Los posgrados en el área de Educación que ofrece la Universidad del Mayab son parte del Centro de Innovación Educativa, cuyos propósitos son:
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Realizar investigación, a través de trabajos generados por los mismos alumnos de posgrado e investigadores afiliados al Centro. Se trabaja con dos líneas prioritarias: Liderazgo educativo, y Enseñanza efectiva.
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Favorecer el desarrollo profesional, a través de los programas de posgrado, como son la Especialización en Liderazgo Docente y la Maestría en Gestión Educativa. El Centro también lleva a cabo seminarios,talleres y cursos cortos; todos ellos con la finalidad de apoyar la mejora continua de losprofesionales de la educación.
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Difundir, a través de publicaciones, productos de investigaciones acerca de las mejores prácticas así como los desarrollos de nuevas tendencias en educación.